重症监护病房耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌感染特点与同源性分析

时间:2023-06-17 12:35:02 公文范文 来源:网友投稿

林佩贤 黄宝添 辜红妮 黄靖宇 许斐斐 林伟青

1 汕头大学医学院第二附属医院医院感染管理科,汕头 515041;
2 汕头大学医学院附属肿瘤医院放疗科,汕头 515041

鲍曼不动杆菌(也称鲍氏不动杆菌)是一种非发酵的革兰阴性菌,其中耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii,CRAB)是引起医院感染的重要病原菌[1]。根据中国抗菌药物监测网的报告,约80%的鲍曼不动杆菌对亚胺培南或美罗培南耐药[2-3],给临床抗感染治疗带来较大困难。WHO 公布的新型抗菌药物研发重点病原体清单中,CRAB 被列为最受关注的革兰阴性菌[4]。ICU 是医院感染多发的科室,ICU 病区鲍曼不动杆菌和CRAB 所致的医院感染分别占20.9%和13.6%[5],也曾有CRAB 引起医院感染流行和暴发的报道[6-7]。本研究对汕头某医院ICU 病区患者CRAB的感染特点和同源性进行分析,现将结果报告如下。

一、研究对象

以2020年7月至2021年6月汕头大学医学院第二附属医院ICU 病区收治的检出鲍曼不动杆菌患者为研究对象,按检出菌是否为CRAB 分为病例组和对照组。医院感染病例诊断标准按原卫生部2001年《医院感染诊断标准(试行)》执行。纳入排除标准:纳入检出鲍曼不动杆菌的病例,排除住院时间少于48 h 的病例,同次住院期间检出耐药菌的病例不纳入对照组。本研究经汕头大学医学院第二附属医院伦理委员会审查通过[审批号:汕大医附二伦审科(2022-104)号]。

二、菌株鉴定和药敏试验

检测患者入院后的痰液或分泌物,收集检出的第1 株鲍曼不动杆菌菌株。按照《全国临床检验操作规程》第3 版要求分离培养病原菌,参照2019年美国临床和实验室标准化协会(CLSI)推荐的药敏试验要求[8],采用法国梅里埃公司的VITEKcompact2 微生物自动分析仪和配套药敏卡进行药敏试验。以大肠埃希菌标准菌株ATCC25922、铜绿假单胞菌标准菌株ATCC27853 进行药敏质控检测。

三、PFGE 试验

挑取鲍曼不动杆菌单菌落接种营养平板,37 ℃孵育过夜。制备胶块,使用60 U ApaⅠ(TAKARA 公司)内切酶进行酶切,在37 ℃孵育4 h。在CHEF-DRⅢ(Bio-Rad Laboratories 公司)电泳仪中进行脉冲场电泳,使用GelRed 核酸染料染色,在读胶仪中成像。PFGE 图像录入BioNumerics 软件包进行处理,经校正后根据每两个图像之间的相似性系数,用非加权配对算术平均法(UPGMA)进行聚类,构建聚类树。PFGE 分型标准:
图谱条带数量和大小相同为同一型别,3 个条带以下有差异为同一型别的不同亚型,4 个条带以上差异为不同型别。

四、耐药基因检测

参照QUIGEN 试剂盒提取细菌基因组DNA 制备DNA 模板。PCR 扩增:(1)VIM、IMP、SIM、NDM-1、ADC 各靶基因 PCR 扩增体系为20 μL:2×Taq Master Mix 10 μL,ddH2O 7 μL,10 μmol/L 上下游引物各1 μL,模版1 μL;
扩增参数为:94 ℃预变性3 min,94 ℃变性50 s,其中退火温度VIM、IMP 和ADC 为55 ℃,NDM-1 和SIM 为58 ℃,退火时间均为30 s,72 ℃延伸30 s,共30 个循环,72 ℃最后延伸6 min。取PCR 反应产物4 μL,以1%琼脂糖凝胶电泳,120 V电泳25 min 后凝胶成像系统成像。阳性PCR 产物送测序公司进行测序。(2)OXA-23、OXA-24、OXA-51、OXA-58 和OXA-143:多重PCR 法,反应体系为20μL:2×Taq Master Mix10 μL,ddH2O 4 μL,正反向引物各0.5 μL(10 μmol/L),模板1 μL。扩增参数为:94 ℃预变性5 min,94 ℃变性50 s,52 ℃退火30 s,72 ℃延伸50 s,共30 个循环,72 ℃最后延伸6 min。取PCR 反应产物4 μL,以1%琼脂糖凝胶电泳,120 V电泳25 min 后凝胶成像系统成像。阳性PCR 产物送测序公司进行测序,将测序结果开展blast 比对进行确认。目的基因和引物序列详见表1。

表1 目的基因和引物序列

五、统计学分析

以Epidata3.1 双录入并核对数据,应用SPSS19.0 进行统计分析。正态性检验方法采用P-P图和Shapiro-Wilk 检验,服从正态分布的计量资料采用均数±标准差(±s)表示,组间比较采用独立两样本均数t 检验。计数资料采用例数和构成比表示,组间比较采用χ2检验。P<0.05 为差异有统计学意义。

一、感染患者一般情况

感染鲍曼不动杆菌患者共41 例,按检出菌是否为CRAB 分为病例组(17 例)和对照组(24 例),其中病例组男性12 例,女性5 例,年龄为(52.06±21.28)岁;
对照组男性22 例,女性2 例,年龄(49.17±20.44)岁,两组性别、年龄分布差异无统计学意义( χ2=3.12,P=0.077;
t=0.44,P=0.663)。结合临床表现,病例组和对照组分别有13 例和15 例判断为感染菌,均为肺部感染,余考虑为定植菌。

二、抗菌药物使用、院感发生情况和转归比较

病例组使用碳青霉烯类抗菌药物、抗菌药物使用天数≥10 d、检出菌为医院感染病原菌的比例分别为9/17、14/17 和12/17,均高于对照组,差异均有统计学意义( χ2=6.05、9.62 和5.53,P 均<0.05)。具体结果见表2。

表2 汕头大学医学院第二附属医院ICU 病区患者的抗菌药物使用、机械通气、院感发生情况和转归比较

三、CRAB 菌株耐药性及同源性分析

1、药物敏感试验结果

由表3可见,检出的CRAB 除对替加环素敏感外,对其他抗菌药物均呈不同程度耐药。对亚胺培南、美罗培南、环丙沙星、头孢曲松、头孢吡肟和复方磺胺甲 唑的耐药/中介率均在80%以上,头孢哌酮/舒巴坦耐药率为11/17,氨基糖苷类中妥布霉素的敏感率稍高,为6/17。

表3 汕头大学医学院第二附属医院ICU 病区耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌的药敏结果(n=17,株)

2、同源性及耐药基因分析

经PFGE 电泳图谱聚类分析,17 株CRAB 分为9 个型别,见图1。其中5 个型别只包含1 株菌株,其余4 个型别分别包含2~4 株菌株,提示可能存在流行病学关联。17 株菌中有16 株检出ADC 基因,1株检出SIM 基因,8 株检出OXA-51-like 基因。4 株CRAB 菌株检测出多个耐药基因。

图1 汕头大学医学院第二附属医院ICU 病区耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌的PFGE 聚类分析图

随着亚胺培南在临床上的广泛应用,对碳青霉烯类抗菌药物耐药的临床分离菌株越来越多[9]。为应对此类广泛耐药细菌所致感染,检验科需要积极与临床医生沟通,开展多黏菌素、替加环素和头孢他啶-阿维巴坦的药敏试验[10]。本文分析汕头某医院ICU 病区CRAB 的感染特点和同源性,可更好地指导临床用药并有效控制相关医院感染。

一、CRAB 菌株耐药率较高

本次研究结果显示,CRAB 感染患者与一般鲍曼不动杆菌患者的性别、年龄无差异,但感染前使用碳青霉烯类抗菌药物和长时间抗菌治疗者检出CRAB 的概率增加,长时间使用抗菌药物促使耐药菌的产生,应持续加强碳青霉烯类抗菌药物合理用药管理[11]。药敏结果显示,CRAB 菌株对除了替加环素外的抗菌药物耐药率均高,基于碳青霉烯类耐药菌株的广泛耐药特征,常规药敏试验结果往往显示仅对替加环素、多黏菌素和头孢他啶-阿维巴坦敏感。同时,报道显示此类患者的住院费用和住院日数也增加[12]。CRAB 菌株多为医院感染致病菌,因此控制CRAB 菌株在医院环境的流行传播是医院感染防控工作的重要内容。

二、CRAB 存在ICU 环境内传播

ICU 内患者和环境中存在鲍曼不动杆菌的克隆传播,造成环境污染以及患者交叉感染[13]。本研究发现大部分CRAB 为医院感染菌,部分PFGE 型别存在多个克隆菌株。现场调查发现ICU 收治的时间有重叠,由同组医护人员诊疗护理,工勤人员进行床单元清洁消毒存在顺序错误、同一清洁巾擦拭范围过大等不规范的情况。结合病例的住院时间、诊疗护理和清洁消毒情况分析,表明虽然散发菌株可能为外部输入,但院内传播仍是CRAB 流行传播的主要形式。ADC 基因是CRAB 固有耐药基因[14],本次检测在17 株CRAB 菌株中有16 株检出ADC 基因,与既往研究结果基本相符[15]。约1/4 的菌株包含2种以上耐药基因,说明其耐药机制具有多样性和复杂性。

三、应采取综合干预措施加强CRAB 防控

主动监测、强化接触隔离和限制抗菌药物使用可减少CRAB 的感染和定植[16]。CRAB 医院感染流行或暴发与环境及物体表面清洁消毒不到位有关,曾有报告ICU 的器械开关检出的鲍曼不动杆菌与患者检出菌株完全同源[17]。医护人员流动性大、岗前培训不足导致床单位终末消毒不彻底可能是CRAB传播的重要原因[18]。

综上所述,CRAB 感染的防控需要采取加强手卫生、个人防护、培训督导、落实日常消毒和终末消毒、规范抗菌药物使用等一系列综合干预措施。但本研究未同步对病房环境进行微生物学采样和同源性分析,以进一步验证CRAB 在病房环境中的传播情况,有待以后的研究中进行深入探讨。

利益冲突所有作者均声明不存在利益冲突

作者贡献声明林佩贤:研究设计和实施、文章撰写、统计分析、获取经费;
黄宝添:研究实施、统计分析、文章审阅;
辜红妮、黄靖宇:实验操作、采集数据;
许斐斐:采集及核校数据;
林伟青:研究设计指导、论文审阅

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